低分子肝素对母体的不良反应非常少见，包括：出血、过敏、血小板减少、转氨酶升高和骨质疏松等。文献回顾 2777 例使用低分子肝素的孕妇中，与原发病相关的出血发生率 1.98％；骨质疏松性骨折发生率 0.04％；过敏反应 1.8％；肝素诱导的血小板减少 0％；与低分子肝素无关的血小板减少 0.11％；活产率 94.7％（包含反复流产人群）；母体死亡 0％。
1. 低分子肝素注射导致的皮下部位损伤及处理：包括：皮肤瘀斑、针眼渗血、血肿、硬结、坏死。原因可能包括适应证或用量掌握不良或注射方法不正确或注射部位和间距不当或按压的力度和时间差异。处理：注意适应证，用药剂量个体化；正确选择注射部位；掌握注射深度与角度；皮褶顶部垂直进针；适当加压和规律轮换间隔注射；不需特别处理（除非皮肤坏死）。
2. 低分子肝素注射导致出血倾向：发生率为 1.5％ 到 20％。包括：鼻血、牙龈出血、阴道出血、血尿、便血、腹腔内或腹膜后出血、其他穿刺部位出血、手术部位出血或者颅内出血。为了避免产后出血，需要在分娩前至少 12 小时停止使用低分子肝素，即可有效避免产后出血。预防出血监测：（1）出血征象；（2）抗 Xa（准确性不高，可比性差）；（3）血小板计数和聚集功能；（4）其他凝血指标。出血处理：减量或停药；止血，对症处理；输血及鱼精蛋白。
3. 低分子肝素注射导致肝功能异常：谷丙转氨酶、草丙转氨酶升高（2％ 和 5％），或伴随碱性磷酸酶、乳酸脱氢酶升高。机制尚不明确。可能与低分子肝素主要在肝脏代谢有关。使用低分子肝素时需要注意与其他药物的协同作用。定期监测肝功能，必要时候减量或停药。可同时使用护肝药。
4. 低分子肝素注射导致骨质疏松症：动物研究显示：阿司匹林降低骨形成和增加骨丢失；低分子肝素只降低骨质形成，对骨质丢失影响更小；多中心多民族随机试验显示孕期使用预防剂量的低分子肝素与骨密度显著降低无相关性！
5. 低分子肝素注射导致血小板减少症：有可能是过敏反应所致，可换成磺达肝素或停药。
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