1、禁用于有出血性素质和伴有血液凝固延缓的各种疾病、肝肾功能不全、严重高血压、脑出血、急性感染引起的心内膜炎（人工瓣膜引起的心内膜炎除外）、大脑手术及脊柱手术后、胃肠道有持续的引流管、流产、活动性肺结核、剥脱性皮肤病、溃疡病及对本品过敏者，以及妊娠末 3个月的孕妇、临产妇。
2、慎用于乙醇中毒、过敏体质、月经期中、有占位性病变者，孕妇及产妇等。
3、如有严重出血现象，可静注硫酸鱼精蛋白急救，注射速度<20mg/分钟或10分 钟内注射50mg为宜（1mg硫酸鱼精蛋白可中和100U肝素钠）。但应注意：①应用鱼精蛋白过量，可有抗凝血作用，因鱼精蛋白干扰凝血致活酶。②由于肝素代谢，故肝素注射后间隔的时间越长，中和肝素所用的鱼精蛋白的量也越小。
4、用药之前，进行血小板计数，用药期间应每周2次做血小板计数，并定期测定凝血时间。如凝血时间>30分钟，表明用药过量。应注意观察有无出血情况。
5、肝素钠皮下注射的一种特殊方法一深皮下脂肪层注射法：注射部位为腹壁或髂嵴上的脂肪层。可避免一般浅层皮下注射易致血肿、疼痛，且作用时间短的缺点。用结核菌素空针抽准剂量，更换注射针头，然后消毒皮肤（消毒时要轻，不可重按，以免皮下出血），在离开肚脐至少5cm处，以及没有疤痕的腹白线以外处提起一块腹壁，固定好针头，慢慢推注药物（不要回抽针芯看回血）。注完后迅速拔出针，在针孔处轻压约1分钟，不可按摩。如此每次更换注射部位。
6、肝素钠有利尿作用，约发生在治疗开始后的36—48小时内，直至停药后的48小时内，应注意使患者多饮水，记好出入量。
7、吸烟、喝酒可影响本品的作用，应禁止。
9、肝素钠可引起血液中的抗凝血酶Ⅲ的消耗增多，在停用本品后的24—48小时后开始恢复正常。在此期间，发生血栓的可能性增多，故不可突然停用，一般于停药前的3—5天加用口服抗凝血药以预防，并逐渐减量直至停用。
10、如有过敏反应时，应及时停药。
11、有发生与创伤有关的出血危险，应避免受创伤，同时停止对患者进行损伤性的操作如肌内注射、导尿等。
12、按干燥品计算，每毫克的效价不得少于150U。
13、用量过大时可引起自发性出血，如：粘膜出血、关节积血、伤口出血等。
14、以下疾病者需禁用：肝肾功能不全、溃疡病、严重高血压、脑出血、孕妇、先兆流产、外科手术后、血友病者。
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