肝素耐药原因的确定基于实验室和临床数据。多种机制导致耐药，并与普通肝素的特异性和患者特异性因素相结合有关。
非特异性结合
带负电荷的强肝素分子与许多蛋白质结合，包括血小板因子 4、富含组氨酸的糖蛋白、脂蛋白、血管性血友病因子、因子 VIII 和纤维蛋白原，以及单核细胞、内皮细胞、生长因子和非内皮表面，包括静脉通路和体外循环通路（表2）。较长的普通肝素聚合物有助于与这些物质结合，并使患者产生反应和剂量需求的广泛变化，而较短的低分子量肝素链则没有这种变化。
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