普通肝素、低分子肝素、磺达肝素均可静脉、皮下注射给药，禁止肌肉注射。
普通肝素，皮下注射的生物利用度仅30%；低分子肝素、磺达肝素皮下注射的生物利用度≥90%。
普通肝素，可被网状内皮细胞系统清除和降解，少量经肾脏排泄；低分子肝素、磺达肝素主要通过肾脏排泄，肾脏功能不全的患者可能发生蓄积，可导致出血。
分子量越小，半衰期越长。
普通肝素血浆半衰期约为1~2小时；低分子肝素的血浆半衰期约为5~7小时；磺达肝素的血浆半衰期约为17~21小时，可每日一次皮下注射。
只能与分子量较大的普通肝素结合，可完全消除普通肝素的抗凝作用（1mg硫酸鱼精蛋白可中和100U肝素），可部分消除低分子肝素的抗凝作用，对磺达肝素的抗凝作用无影响。
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